A 2006-10-es választási ciklusban az akkori városvezetés fiskális és esélyegyenlőségi motivációk miatt több iskola bezárását tervezte, illetve hajtotta végre Bátonyterenyén. A szülők egy népes csoportja keresve a jövőt és megpróbálva megvédeni gyermekeik érdekeit, olyan alternatívát keresett a gyermekek nevelésére, amely a 2000 éves keresztény tanítással szinkronban becsületes és méltó környezetet teremt a jövő generációjának a nevelésére. Felkeresték dr. Beer Miklóst a váci Egyházmegye püspökét, hogy alapítson iskolát Bátonyterenyén, vagy vegye át az elsorvasztásra kárhoztatott intézményt. A 2010-es kormányzatban és a városvezetésben bekövetkezett változások után az új vezetés generátorává vált a folyamatnak, amelyben találkozott a város, a katolikus egyház, illetve a társadalom érdeke is. Alapítani kell egy olyan iskolát, amelyben az oktatás mellett olyan erkölcsi alapokon folyó nevelő munka kell hogy álljon, amely a gyermekeknek biztos támaszt fog adni a felnőtt életben való boldogulásban. Ez a biztos alap pedig a keresztény tanítás és erkölcs, amelynek a legfőbb parancsa a szeretet.
A névválasztásnál adta magát az ifjúság pápájának és a szeretet legfelsőbb szószólójának a személyisége, aki életútjával jó példa a mai fiatalság és mindannyiunk számára.
A 2012/2013-as tanévben egy új tagintézménnyel , az Angyalkert Katolikus Óvodával bővült intézményünk. Valóra vált álmunk: a lehető legkorábban elkezdeni gyermekeink katolikus szellemiségű nevelését.
Egy másik tagintézménnyel is bővült az intézmény: a Mátramindszenti Tagintézménnyel. A falu vezetése és szülői köre többször is próbálkozott már, hogy iskoláját a Katolikus Egyház kezébe helyezze, azzal a meggyőződéssel, hogy modern világunkban a gyermekek nevelése itt lesz legjobb helyen. Az évszázadok alatt kikristályosodott erkölcsi értékek kellő alapokat nyújtanak a fiataloknak, melyre további életüket építhetik. Beer Miklós püspök atya a II. János Pál Katolikus Óvoda és Általános Iskola tagintézményeként lehetőséget biztosított a falu lakosságának, hogy régi álmát megvalósítsa.